1908年 12月24日 長崎市平和町の浦上天主堂下手に長崎医学専門学校生のための寮として創設される。
1923年 ３月 長崎医科大学と改称される。
1930年
大改修工事がされる。
1945年 ８月９日 原子爆弾により灰燼に帰す。
1947年
国立長崎大学発足。長崎医科大学ＹＭＣＡ浦山寮から長崎大学ＹＭＣＡ浦山寮となる。
1953年 １月15日 二代目浦山寮再建される。
1973年 11月23日 現在地の上銭座町に三代目浦山寮が移転新築される。
2005年 〜 2007年 大改修される。